Il periodo migliore per viaggiare in Mali è tra ottobre e marzo, sebbene a partire da gennaio al centro-nord può soffiare l’harmattan, vento del deserto in grado di portare tempeste di sabbia. In inverno le notti possono essere molto fredde al nord con temperature che possono raggiungere anche lo zero mentre a Bamako, la capitale, si attestano sui sette/otto gradi. In generale, nel Mali è possibile riscontrare tre tipologie di clima: al nord il clima desertico del Sahara; al centro il clima semi-desertico del Sahel, che prevede una stagione delle piogge da giugno a settembre e al sud il clima tropicale della savana, dove la stagione piovosa è più intensa e le precipitazioni cadono tra maggio e ottobre.
Nel programmare un viaggio nel paese, vanno tenuti in conto anche i numerosi festival musicali/culturali che ospita: il Festival del Deserto a Gennaio (attualmente sospeso), il Festival sul Niger di Segou a Febbraio, il Festival delle marionette di Markala a Marzo, il Crepissage della moschea di Djenne ad Aprile, la pesca sacra Sankemon a San tra Maggio e Giugno, la Biennale della fotografia africana ad Ottobre, il Festival Bogo Dja a Siby e il Festival Dogon sulla falesia a Dicembre (attualmente effettuato a Bamako a Gennaio).